Index B | C | D | F | G | I | L | M | O | P | R | S | T | V | W B BFXPipeline (class in bionty) bionty module Bionty (class in bionty) bionty.dev module C CellLine (class in bionty) CellMarker (class in bionty) CellType (class in bionty) D df() (bionty.BFXPipeline method) (bionty.Bionty method) (bionty.CellMarker method) (bionty.Species method) Disease (class in bionty) display_available_sources() (in module bionty) display_currently_used_sources() (in module bionty) Drug (class in bionty) F fields (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Readout attribute) (bionty.Species attribute) (bionty.Tissue attribute) fuzzy_match() (bionty.Bionty method) (bionty.Gene method) G Gene (class in bionty) get_term() (bionty.Ontology method) I inspect() (bionty.Bionty method) L LOCAL_SOURCES (in module bionty) Lookup (class in bionty) lookup() (bionty.Bionty method) (bionty.Gene method) (bionty.Lookup method) M map_synonyms() (bionty.Bionty method) module bionty bionty.dev O Ontology (class in bionty) ontology_info() (in module bionty.dev) P Pathway (class in bionty) Phenotype (class in bionty) Protein (class in bionty) R Readout (class in bionty) reset_sources() (in module bionty) S source (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Readout attribute) (bionty.Species attribute) (bionty.Tissue attribute) species (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Readout attribute) (bionty.Species attribute) (bionty.Tissue attribute) Species (class in bionty) T Tissue (class in bionty) todict() (bionty.Lookup method) V version (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Readout attribute) (bionty.Species attribute) (bionty.Tissue attribute) W write_obo() (bionty.Ontology method)